Packages de chargement en r

«La création de packages est un bon moyen de faire en sorte que votre travail / code / programme l'organiser et le partager avec les autres afin qu'ils puissent le réutiliser. Code, ensembles de données, documentation de ces fonctions qui sont utilisées dans le package, et certains tests sont contenus par un package. Nous pouvons télécharger et installer les packages à partir de référentiels. Un référentiel est un emplacement ou une plate-forme pour stocker des packages afin que tout le monde puisse les utiliser après l'installation. Les organisations et les développeurs ont chacun leur référentiel local, qui est généralement en ligne et ouvert au public. Cran, BioConductor et Github sont parmi les référentiels R Package les plus importants."

Quels sont les packages dans le langage de programmation R dans Ubuntu 20.04?

Il s'agit d'une collection d'échantillons de données, de fonctions R et de scripts de compilation. Ces forfaits sont situés dans le répertoire de l'environnement R, connu sous le nom de bibliothèque. Un ensemble de packages est installé par R pendant le processus d'installation. Des packages peuvent être ajoutés plus tard s'ils sont requis pour une fonctionnalité ou un objectif spécifique. Lorsque nous démarrons la console R, les packages par défaut seront disponibles uniquement pour une utilisation. Pour utiliser des packages qui ont déjà été installés dans notre système, nous devons les charger explicitement.

Comment charger et utiliser des packages dans un langage de programmation dans Ubuntu 20.04?

Vous devez d'abord installer, puis charger un package dans votre bibliothèque R avant de pouvoir l'utiliser. La bibliothèque est un répertoire dans lequel les packages de la session R actuels sont chargés. Les packages doivent être chargés dans la bibliothèque pour chaque session.

Voici quelques exemples dans lesquels nous verrons comment installer les packages en R afin qu'ils puissent être chargés pour une utilisation dans le langage de programmation R

Exemple 1: Installation des packages R

Il existe différentes façons d'installer les packages en R. Nous n'en discuterons que quelques-uns dans cet exemple.

Installation de Cran

Cran est un acronyme pour le réseau d'archives R complexe. C'est le référentiel officiel de la communauté R, qui est mis à jour régulièrement. Pour être accepté dans Cran, un package doit passer une série de tests pour s'assurer qu'il est conforme aux règles et politiques de Cran. Pour installer un package de Cran, vous devez connaître le nom de ce package, afin que nous puissions l'utiliser dans la commande suivante.

Le compilateur démarrera le processus d'installation en appuyant sur Entrée après la commande ci-dessus. Plusieurs packages peuvent être installés à la fois. Pour cela, nous écrire les noms des packages en tant que vecteur de caractère.

Installation à partir de bioconducteur

La façon standard d'installer un package à partir de bioconducteur passe l'URL suivante à l'intérieur de la fonction source.

Cela installera la fonction qui est nécessaire pour installer des packages de bioconducteur. Après avoir installé la fonction requise, vous pouvez simplement écrire le nom des packages de bioconducteur ou le vecteur de caractère de leurs noms à l'intérieur de la fonction vioClite ().

Installation à partir de github

Le package R Devtools peut être utilisé pour installer un package à partir de GitHub. Il aidera les utilisateurs en fournissant les fonctions nécessaires pour simplifier les tâches courantes dans R.

Les instructions suivantes peuvent être utilisées pour installer les packages GitHub. Vous pouvez donner un chemin à la place de «package_path» pour installer le package requis.

Exemple 2: Chargement des packages R

Après avoir terminé l'installation de packages dans l'environnement R, pour rendre les packages utiles, nous devons les charger en R pour la session en cours.

La commande Library () peut être utilisée pour charger le package de langue R, comme indiqué ci-dessous:

Vous pouvez écrire le nom du package requis dans la fonction de bibliothèque si nous devons charger un package qui a été installé précédemment mais n'est pas disponible dans l'environnement que nous utilisons. La commande suivante est utilisée pour charger un package.

Ici Lib () est une fonction utilisée pour donner le chemin de la bibliothèque dans laquelle les packages R installés sont situés / stockés. Pour charger un fichier dans la session en cours, nous utiliserons l'instruction ci-dessous.

Dans l'installation.packages () nous spécifierons le chemin de notre package où se trouve notre package. Si nous avons juste besoin d'accéder à quelques fonctions ou données dans un package à l'origine, nous pouvons utiliser la commande suivante.

Dans l'exemple ci-dessus, nous utiliserons le nom du package à partir duquel nous voulons utiliser une fonction spécifique, et nous écrire le nom de la fonction à la place de «function_name ()."

R vous permet également de décharger un package de la session en cours en utilisant la commande detach ().

Exemple 3: Gestion des packages R

Dans R, vous pouvez utiliser certaines commandes pour vous aider à gérer les packages que vous utilisez et installer. Nous pouvons également voir quels packages sont disponibles, ainsi que quels packages sont installés et chargés dans notre environnement. Nous pouvons vérifier les mises à jour disponibles et nous assurer qu'ils sont à jour. La commande suivante montre une liste des packages R chargés dans la session en cours en utilisant la recherche ().

Pour vérifier quels packages sont installés dans notre système, nous utiliserons installé.Commande packages ().

Il fournira une matrice avec une ligne pour chaque package et colonnes pour obtenir des informations sur les packages comme le chemin de la bibliothèque, les versions, les dépendances, les détails de licence, etc.

Les packages installés peuvent être mis à niveau en utilisant la mise à jour.Commande packages ().

Si nous n'écrivons pas le nom du package dans la commande, il vérifiera tous les packages de notre système pour les mettre à jour.

Nous pouvons également supprimer un package de notre système en utilisant la suppression.Commande packages ().

Vous rédigerez le nom du package dans la commande ci-dessus pour le supprimer de votre système.

Conclusion

Dans cet article, nous avons essayé de vous apprendre le concept de base des packages R et comment vous pouvez les utiliser dans le langage de programmation R dans Ubuntu 20.04. Maintenant, vous devriez être capable d'installer des packages et de les charger sur votre système. Nous avons mis en œuvre quelques exemples dans ce tutoriel pour vous expliquer comment installer des packages à partir de différents types de référentiels, comment vous pouvez les charger dans la session en cours, comment les détacher, comment vérifier les packages installés sur votre système, comment mettre à jour eux, et comment supprimer les packages de votre système qui ne sont plus nécessaires.